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📌 Services
The Biomics Platform is the C2RT structure at Institut Pasteur for Next Generation Sequencing short and long-read technologies. You will find all the detailed information on our services and processes on the Biomics website.
📌 Resources and Mission
The mission of the Biomics Platform is to facilitate scientific discovery within the Institut Pasteur network and academic research institutes. Biomics accepts all types of projects and works closely with the C3BI and the DSI to provide data analysis and storage solutions for researchers. Members of the Biomics platform provide advice on project implementation, which applicants may choose to follow or not. In the latter case, the Biomics platform reserves the right not to publish results derived from such projects.
📌 Publication Policy
The Wet-Lab, Dry-Lab and Support-Lab activities (sample QC, library preparation, technology choice, sequencing, design, tools, software and bioinformatic analysis) represent a significant investment of time by the Biomics staff. This expertise is central to our services and integral to the success of your scientific project. Any publication derived from a Biomics project should include the following acknowledgment:
“Names Surnames, Biomics Platform, C2RT, Institut Pasteur, Paris, France, supported by France Génomique (ANR-10-INBS-09) and IBISA.”
A good-faith discussion regarding authorship will take place depending on the level of involvement of Biomics staff.
📌 Data Storage Policy
Raw data is stored and archived by Biomics for a maximum of 5 years (data transfer is free of charge for the first 2 years). A contribution to disk space costs is included in the quote. Applicants agree that their data may be used for internal development projects. Please download our Data Management Plan: Biomics_DMP.
📌 Biological Sample Storage Notes
Researchers should specify how any remaining biological material should be handled after project completion. If not specified, samples will be destroyed by Biomics after 1 year.
Human Samples: Applicants confirm that they possess all necessary authorizations for the analysis of samples.
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Biomics Platform
Autonomous: Sequencing
- Independent use of the equipment after training (Moocs)
- Outsourcing of libraries (High Throughput only, NovaSeq)
- https://moocs.pasteur.fr ; Biomics_Autonomy.pdf
Howto: Libraries preparation
- List of essential laboratory equipments
- Provision of simplified protocols
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Rencontrez Notre Équipe
Une équipe multidisciplinaire dédiée à l’excellence scientifique, à l’innovation et au développement des technologies omiques.
Dr. Sinda Zarrouk, PhD
Experte en gestion de projets omiques et recherche translationnelle. Supervise le développement technologique et l’excellence scientifique.
Support & Qualité
Neila Khabouchi
Supervision des processus qualité, conformité aux normes et amélioration continue des procédures.
Qualité Normes AuditÉquipe Wet-Lab
Saifeddine Azouz
Spécialisé en séquençage NGS et biologie cellulaire. Responsable des protocoles expérimentaux.
NGS Biologie cellulaire ProtocolesDhia Eddine Issaoui
Préparation des échantillons, analyses de routine et support technique quotidien en laboratoire.
Échantillons Analyses Support laboÉquipe Dry-Lab
Hayfa Bououd
Développement de pipelines bioinformatiques et analyses statistiques avancées des données omiques.
Bioinformatique Pipelines Statistiques- Category: Uncategorised
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Infrastructure de pointe
pour la recherche en génomique et biologie moléculaire
EXTRACTION & Fragmentation
QIAcube
Préparation automatisée d'échantillonsAutomatisation de la purification d'ADN, ARN et protéines. Résultats de haute qualité avec un temps de manipulation minimal.
Automatisation complètePerkinElmer Chemagic 360
Isolation haut débit d'acides nucléiquesIsolation d'acides nucléiques à haut débit à partir de divers types d'échantillons utilisant la technologie à billes magnétiques.
Haute capacitéBioRuptor
Système de cisaillement ultrasoniqueSystème de cisaillement ultrasonique pour un cisaillement efficace de la chromatine et l'extraction d'ADN et de protéines.
Cisaillement précisCONTROLE QUALITÉ
Bioanalyzer 2100
Plateforme microfluidiquePlateforme microfluidique pour le dimensionnement, la quantification et le contrôle qualité de l'ADN, de l'ARN et des protéines.
Analyse complèteQIAxpert
Spectrophotométrie UV/VisSpectrophotométrie UV/Vis rapide et haute vitesse pour la quantification d'acides nucléiques et de protéines.
Mesures rapidesQubit
Quantification par fluorescenceQuantification hautement sensible basée sur la fluorescence des concentrations d'ADN, d'ARN et de protéines.
Haute sensibilité- Category: Uncategorised
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Ce que nous proposons :
Visualisation d'ARNm à haute résolution, à haute vitesse
Visualisation de coloration immunohistochimique Fluorescente
Imagerie de cellules vivantes
Fluorescence de l'hybridation in situ du miARN (miRNA-FISH)
Formation et régénération des tissus
Imagerie in vivo
Hybridation in situ fluorescente
Imagerie des tissus clarifiés
Imagerie des tissus profonds dans les limites de pénétration de la lumière dans les tissus
Imagerie des tissus colorés par anticorps
Étude de la dynamique moléculaire
Détection de cellules exprimant le marqueur fluorescent souhaité en réponse à un traitement pharmacologique
Suivi du déplacement des vésicules et des organites
IPT-Omics est une plateforme mutualisée de l’Institut Pasteur de Tunis, membre du Réseau Pasteur international, offrant des services omiques et d’imagerie de pointe pour accompagner la recherche, le diagnostic et l’innovation biomédicale.