Métagénomique

 

Une Analyse Puissante des Communautés d'Organismes

À la plateforme IPT-omics, nous transformons les données métagénomiques en données exploitables grâce à des analyses sur mesure et un accompagnement scientifique de pointe.

Pourquoi Choisir la Métagénomique ?

 

La métagénomique permet d'analyser la diversité et le fonctionnement des communautés microbiennes directement dans leur environnement, sans culture préalable. Elle offre une compréhension approfondie de la composition, des interactions et des fonctions du microbiote, ouvrant la voie à des applications majeures.

Santé Humaine & Animale

Dermocosmétique

Environnement

Agriculture

Aquaculture

Industrie

La Métagénomique : Notre Expertise

 

Notre expérience nous a aidé à développer et à affiner des méthodologies robustes et adaptées à la singularité de chaque type d'échantillon, garantissant ainsi la pertinence et la fiabilité de vos résultats.

Vous serez accompagné(es) par une équipe multidisciplinaire d'experts en bioinformatique et microbiologie, assurant une prise en charge complète et personnalisée de votre projet.

Notre Workflow Appliqué à la Métagénomique

 
 
1
Extraction optimisée de l'ADN
Pour chaque matrice : selles, sols, peau, ferments, etc.
 
2
Préparation des librairies
Avec des contrôles de qualité intégrés
 
3
Séquençage haut débit adapté
Technologies de pointe
 
4
Analyse bioinformatique
Traitement des données massives
5
Interprétation & restitution
Rapport détaillé et actionnable

L'Assurance Qualité au Cœur de Notre Démarche

 

Nous avons mis en place un système de contrôle qualité interne systématique et exhaustif permettant de valider la performance de nos protocoles et d'assurer l'intégrité de vos résultats.

Vous bénéficierez de résultats clairs et interactifs conçus pour une compréhension approfondie et une exploitation optimale de vos données.

Des Méthodologies Adaptées à Chaque Type d'Échantillon

 

Chaque matrice biologique ou environnementale est unique et nécessite une approche spécifique. Grâce à notre expertise, nous avons développé des protocoles optimisés pour différentes matrices.

Humain

Animal

Végétal

Environnemental

Plus de Technologies, Plus de Personnalisation

 

Nous proposons des technologies de séquençage de l'ADN entièrement adaptées à vos objectifs analytiques:

Illumina (short-read)

Lectures précises à haut débit, idéal pour les analyses quantitatives et taxonomiques

Oxford Nanopore (long-read)

Résolution longue, idéale pour la caractérisation fine des génomes microbiens

Selon le niveau d'analyse souhaité, nos protocoles sont disponibles en :

Métabarcoding (16S, 18S, ITS)

Approche ciblée pour l'identification taxonomique

Shotgun métagénomique

Exploration exhaustive de la diversité taxonomique et fonctionnelle

Profondeur de séquençage ajustée en fonction de vos besoins spécifiques, en tenant compte de la richesse et de la complexité du microbiote étudié.