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Métagénomique
Métagénomique
Une analyse puissante des communautés d'organismes
Chez IPT-Omics, nous transformons les données métagénomiques en insights exploitables, grâce à des analyses sur mesure et un accompagnement scientifique de pointe.
Pourquoi choisir la métagénomique ?
La métagénomique permet d'analyser la diversité et le fonctionnement des communautés microbiennes directement dans leur environnement, sans culture préalable. Elle offre une compréhension approfondie de la composition, des interactions et des fonctions du microbiome, ouvrant la voie à des applications majeures.
Santé humaine et animale
Microbiote intestinal, probiotiques, maladies.
Dermocosmétique
Microbiote cutané et produits cosmétiques.
Environnement
Sols, eaux, biodiversité microbienne.
Biotechnologies
Procédés industriels et biotransformation.
Agriculture
Microbiote des sols et des plantes.
Aquaculture
Microbiote des organismes aquatiques.
La métagénomique : notre expertise
Notre expérience nous a aidés à développer et à affiner des méthodologies robustes et adaptées à la singularité de chaque type d'échantillon, garantissant ainsi la pertinence et la fiabilité de vos résultats.
Vous serez accompagné(e) par une équipe multidisciplinaire d'experts en bioinformatique et microbiologie, assurant une prise en charge complète et personnalisée de votre projet.
Notre workflow appliqué à la métagénomique
Extraction ADN optimisée
Pour chaque matrice : selles, sols, peau, ferments, etc.
Préparation des librairies
Avec contrôles qualités intégrés
Séquençage haut-débit adapté
Technologies de pointe
Analyse bioinformatique
Traitement des données massives
Interprétation & Restitution
Rapport détaillé et actionnable
L'assurance qualité au cœur de notre démarche
Nous avons mis en place un système de contrôle qualité interne systématique et exhaustif permettant de valider la performance de nos protocoles et d'assurer l'intégrité de vos résultats.
Vous bénéficierez de résultats clairs et interactifs, conçus pour une compréhension approfondie et une exploitation optimale de vos données.
🔬 Des méthodologies adaptées à chaque type d'échantillon
Chaque matrice biologique ou environnementale est unique et nécessite une approche spécifique. Grâce à notre expertise, nous avons développé des protocoles optimisés pour différentes matrices.
Humain
Animal
Végétal
Environnemental
⚙️ Plus de technologies, plus de personnalisation
Nous proposons des technologies de séquençage ADN entièrement adaptées à vos objectifs analytiques :
Illumina (Short-read)
Lectures précises à haut débit, idéal pour les analyses quantitatives et taxonomiques.
Oxford Nanopore (Long-read)
Résolution longue, idéale pour la caractérisation fine des génomes microbiens.
Selon le niveau d'analyse souhaité, nos protocoles sont disponibles en :
Métabarcoding (16S, 18S, ITS)
Approche ciblée pour l'identification taxonomique.
Shotgun métagénomique
Exploration exhaustive de la diversité taxonomique et fonctionnelle.
Profondeur de séquençage ajustée en fonction de vos besoins spécifiques, en tenant compte de la richesse et de la complexité du microbiote étudié (humain, animal, végétal ou environnemental).