NGS – Toute la puissance de la génomique au service des sciences de la vie

La plateforme IPT-Omics met à disposition des technologies de séquençage de nouvelle génération (Next-Generation Sequencing, NGS) permettant l’analyse approfondie des génomes, transcriptomes et microbiomes.

Grâce à un plateau technologique dédié et à des outils d’analyse bioinformatique adaptés, la plateforme accompagne les projets de recherche en biologie, microbiologie, génomique médicale et environnementale.

Ces technologies permettent d’explorer la diversité génétique, de caractériser les organismes et d’étudier les mécanismes moléculaires impliqués dans de nombreux processus biologiques.

Nos services en NGS

• Séquençage de génome complet

• Transcriptomique (RNA-seq)

• Métagénomique

• Séquençage ciblé

Séquençage de génome complet

Le séquençage du génome complet permet d’analyser l’ensemble de la structure génétique d’un organisme, qu’il soit procaryote, eucaryote ou viral.

Cette approche permet de :

• caractériser de nouveaux organismes

• identifier des variants génétiques

• étudier l’évolution et la diversité génétique

• soutenir de nombreuses applications en recherche biomédicale, environnementale et microbiologique.

Transcriptomique (RNA-seq)

Le séquençage du transcriptome permet d’analyser l’ensemble des ARN exprimés dans une cellule ou un tissu.

Cette approche est utilisée pour :

• analyser l’expression des gènes

• identifier des transcrits nouveaux ou rares

• réaliser des analyses d’expression différentielle entre conditions biologiques.

Métagénomique

Les approches métagénomiques permettent d’étudier l’ensemble des génomes présents dans un environnement donné (sol, microbiote, eau, etc.).

Elles permettent notamment de :

• caractériser la composition des communautés microbiennes

• identifier les fonctions biologiques présentes dans un microbiome

• étudier les interactions entre organismes dans des écosystèmes complexes.

Séquençage ciblé

Le séquençage ciblé permet l’analyse de gènes ou de régions spécifiques du génome sur un grand nombre d’échantillons en parallèle.

Cette approche offre :

• une analyse précise de régions d’intérêt

• une génération de données optimisée

• une analyse plus simple que le séquençage de génome complet.

Les atouts de la plateforme IPT-Omics

• Accès à des technologies modernes de séquençage

• Accompagnement scientifique pour la conception des projets

• Expertise en génomique et bioinformatique

• Analyses adaptées aux besoins de recherche

• Production de données de haute qualité