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📌 Services
La plateforme technologique IPT-Omics de l’Institut Pasteur de Tunis propose des services en technologies Omiques, couvrant la génomique la protéomique, l’imagerie avancé et l’accompagnement scientifique des projets de recherche.
📌 Publication Policy
La plateforme n'est pas un simple prestataire, mais un partenaire scientifique. À ce titre, toute exploitation des résultats obtenus via l'unité doit mentionner formellement l’IPT-Omics et l’Institut Pasteur de Tunis. L'implication du personnel de l'unité dans la conception expérimentale et l'interprétation des données justifie une discussion de bonne foi sur la co-signature des publications, conformément à l'apport intellectuel fourni.
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IPT-Omics Platforme
- Autonome : Séquençage
- Comment faire : Préparation des librairies
- Liste des équipements de laboratoire essentiels
- Fourniture de protocoles simplifiés
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Rencontrez Notre Équipe
Une équipe multidisciplinaire dédiée à l’excellence scientifique, à l’innovation et au développement des technologies omiques.
Dr. Sinda Zarrouk, PhD
Responsable IPT-Omics
Leadership & Gestion Experte en gestion de projets omiques et recherche translationnelle. Supervise le développement technologique et l’excellence scientifique.
Gestion Recherche Innovation Supervision
Support & Qualité
Neila Khabouchi
Superviseure Qualité
Assurance qualité Supervision des processus qualité, conformité aux normes et amélioration continue des procédures.
Qualité Normes AuditÉquipe Wet-Lab
Saifeddine Azouz
Ingénieur en Chef
Techniques moléculaires Responsable des protocoles expérimentaux.
NGS Biologie cellulaire ProtocolesDhia Eddine Issaoui
Technicien de Laboratoire
Support expérimental Préparation des échantillons, analyses de routine et support technique quotidien en laboratoire.
Échantillons Analyses Support laboÉquipe Dry-Lab
Hayfa Bououd
Ingénieure Bioinformatique
Analyse omiques Développement de pipelines bioinformatiques et analyses statistiques avancées des données omiques.
Bioinformatique Pipelines Statistiques- Details
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INFRASTRUCTURE DE POINTE
pour la recherche en génomique et biologie moléculaire
EXTRACTION & FRAGMENTATION
QIAcube
Préparation automatisée d'échantillons
PerkinElmer Chemagic 360
Isolation haut débit d'acides nucléiques
BioRuptor
Système de cisaillement ultrasonique 
CONTROLE QUALITÉ
Bioanalyzer 2100
Plateforme microfluidique
QIAxpert
Spectrophotométrie UV/Vis
Qubit
Quantification par fluorescence
SÉQUENCAGE
Séquençage Sanger
ABI 3500 Genetic Analyzer
SeqStudio Genetic Analyzer
NGS
Illumina iSeq 100
Illumina NextSeq 1000
Oxford Nanopore sequencing technology
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⚠️ Ce service est en cours de développement
Ce que nous proposons :
Service
Visualisation d'ARNm à haute résolution, à haute vitesse
Service
Visualisation de coloration immunohistochimique Fluorescente
Service
Imagerie de cellules vivantes
Service
Fluorescence de l'hybridation in situ du miARN (miRNA-FISH)
Service
Formation et régénération des tissus
Service
Imagerie in vivo
Service
Hybridation in situ fluorescente
Service
Imagerie des tissus clarifiés
Service
Imagerie des tissus profonds dans les limites de pénétration de la lumière dans les tissus
Service
Imagerie des tissus colorés par anticorps
Service
Étude de la dynamique moléculaire
Service
Détection de cellules exprimant le marqueur fluorescent souhaité en réponse à un traitement pharmacologique
Service
Suivi du déplacement des vésicules et des organites
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Séquençage Sanger
Le séquençage Sanger est une méthode fiable pour l’analyse de fragments d’ADN (100–1200 pb).
Il est particulièrement utilisé pour la validation de variants, l’analyse de produits PCR et le séquençage ciblé.
Notre équipe assure la prise en charge complète : préparation des échantillons, séquençage et analyse.
Séquençage NGS
Les technologies NGS (Next-Generation Sequencing) permettent l’analyse rapide et à haut débit du matériel génétique.
Nos applications incluent :
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Séquençage de génome complet (WGS)
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Séquençage d’exome (WES)
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Séquençage ciblé de panels de gènes
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Transcriptomique (RNA-Seq) pour l’analyse de l’expression des gènes.
Ces approches sont largement utilisées en recherche biomédicale, médecine de précision et biotechnologie.
Métagénomique
La métagénomique permet d’étudier la diversité et les fonctions des communautés microbiennes directement dans leur environnement.
Nous proposons :
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Métabarcoding (16S, 18S, ITS)
-
Shotgun métagénomique
Les analyses sont réalisées avec des technologies Illumina et Oxford Nanopore.
qPCR sur mesure
Nous développons des tests qPCR personnalisés pour la détection et la quantification de gènes ou de microorganismes spécifiques.
Analyse Bioinformatique
Transformez vos données brutes en connaissances exploitables du variant calling à l'interprétation biologique.
Nos pipelines bioinformatiques automatisés incluent :
Niveau 1 (Standard)
Démultiplexage, contrôle qualité, alignement, variant calling
Niveau 2 (Avancé)
Annotation fonctionnelle, filtrage de variants, rapports intermédiaires
Niveau 3 (Expert)
Interprétation biologique, visualisations avancées, analyses statistiques personnalisées
Besoin d'analyses sur mesure ?
Nous développons des solutions bioinformatiques adaptées à votre question de recherche.
IPT-Omics est une plateforme mutualisée de l’Institut Pasteur de Tunis, membre du Réseau Pasteur international, offrant des services omiques et d’imagerie de pointe pour accompagner la recherche, le diagnostic et l’innovation biomédicale.